应届毕业生在签订三方协议时通常会约定违约金。根据《中华人民共和国劳动民法典》的规定，劳动者违反合同解除或者终止劳动合同的，应当按照双方约定向用人单位支付违约金。具体金额需要双方协商确定，并且不得超出法律法规规定的上限。 一般来说，如果违约金的数额超过了法定标准（一般为同期银行存款利率的3倍），则可能被认为是不合理的。因此，在签订三方协议时，建议明确告知违约责任和相应的违约金标准，并确保该条款符合法律规定。 此外，应注意，违约金的支付应在发生实际违约行为后立即进行，而不是在后续时间或情况下支付。同时，任何关于违约金的约定都应经过充分的协商，并以书面形式确认，以确保其合法性及合理性。