在您与个体老板签订的工程合同中，如果没有挂靠公司的公章，而只有个体老板的签名和指印，这通常意味着个体老板是作为个人而非代表任何组织或公司进行合同谈判。在这种情况下，个体老板可能承担的主要责任是他自己的违约责任，即他违反了合同中的条款。 然而，如果您认为个体老板的行为对挂靠公司造成了损害，或者挂靠公司也应为个体老板的行为负责，那么挂靠公司也可能成为被告之一。这种情况下，法院可能会要求挂靠公司承担相应的赔偿责任。 因此，在处理此类案件时，关键在于明确各方的责任，并根据实际情况确定最终的法律后果。建议您寻求专业的法律顾问帮助，以确保您的权益得到充分保护。