根据您提供的信息，孩子目前处于哺乳期，并且双方存在矛盾导致长期分居。在这种情况下，孩子抚养权的归属将取决于多个因素，包括但不限于。 孩子的成长环境。孩子的成长环境对其性格形成具有重要影响。长期分居可能会对孩子的情感和社交发展产生负面影响。 双方的经济条件和社会地位。经济条件和教育背景会影响一个人的生活方式和价值观。如果一方拥有更好的经济条件和社会地位，可能更容易获得孩子的抚养权。 孩子的意愿。孩子的意见也很重要。如果孩子愿意与母亲一起生活，那么他/她可以成为决定性因素。 法律规定。中国的法律规定，父母应当共同承担起抚养子女的责任，除非有特殊原因（如虐待或严重犯罪行为等）。因此，在这种情况下，孩子抚养权的归属应该由法院判决。 总之，孩子的健康成长是最重要的考虑因素之一。如果您担心孩子长期分居会对孩子造成不良影响，建议您寻求专业的心理咨询师的帮助，以便更好地处理这一问题。同时，为了孩子的利益，您也可以考虑与对方协商解决争端，达成有利于孩子的协议。最后，请记得在任何决策中都要考虑到孩子的最佳利益。