你好，我想咨询一下，由于上海疫情，公司居家办公，居家办公之前公司有说按上下班时间打卡，在居家办公期间由于忘记打卡有5次实际已经工作但迟到打卡的记录，按记录迟到时间2-7分钟，由于晚打卡所以下班也有自觉加班半小时左右，人事说根据规定每次迟到扣款20元，说签过员工手册，但本人对此员工手册无印象且没找到员工手册的公示，另外由于公司规定加班一个小时内不计入加班算正常工作，所以人事的通知是需要扣迟到罚款但加班不算，想问一下这种情况合法么？可以申请劳动仲裁么？