在办理离婚案件中，涉及到信仰自由和宗教活动的法律规定较为复杂。如果妻子因长期信奉邪教而与丈夫分居，这可能会影响夫妻关系及家庭和谐。根据我国相关法律法规，对于涉及信仰自由的问题，需要具体情况具体分析，以确保法律程序公正合理地进行。 首先，婚姻法规定了夫妻双方有平等的婚姻自主权，包括决定是否结婚以及维持或解除婚姻的权利。因此，在考虑离婚时，应当充分尊重夫妻双方的真实意愿，并考虑是否存在一方严重违反社会公德的情况，如长期从事违法活动等。 其次，关于分居生活，一般情况下，法院会考虑到分居的原因、时间长度以及对家庭的影响等因素来确定是否支持离婚。但需要注意的是，任何情况下都应尽量避免将个人信仰作为判断离婚的因素之一，因为这种做法可能会侵犯到对方的宗教信仰自由。 最后，建议您在处理此类案件时，寻求专业的法律帮助，以便更好地了解和运用相关的法律法规，同时保护自己的合法权益不受侵害。在处理过程中，也要注意收集和保存好相关证据，为将来可能的诉讼做好准备。