根据您提供的信息，患者在车祸中受伤并进行了十二指肠修复手术。然而，在后续治疗过程中，他被诊断出患有颅内感染病毒性脑炎，并且没有家族遗传性病史。 在这种情况下，医疗机构通常会依据相关的医疗标准和法律规定来评估责任。如果医疗机构未能尽到合理的诊疗义务，如未及时发现并处理患者的疾病，可能会被视为主要责任方。然而，如果医疗机构采取了适当的措施并且已经尽力提供最佳的治疗，那么他们可能不会承担全部的责任。 此外，由于患者的具体情况和病因复杂，医生需要考虑多种因素才能做出最终的判断。因此，医学会进行鉴定并给出次要责任方和主要责任方的结论，可能是基于对当时医疗状况的理解和分析的结果。 在您的案例中，患方认为院方应该承担主要责任，而医学会则认为应由患方承担主要责任。这可能是因为医学会参考了患者的具体情况和医疗历史，以及当时医疗机构的诊疗水平等因素来作出这样的决定。 请注意，以上解释仅供参考，具体情况可能因地区法规和案件细节的不同而有所不同。如果您有更具体的问题或需要进一步的帮助，请咨询专业的法律顾问。