您好！您作为公司的股东之一，有权要求法院对您的权益进行保护。如果您认为银行账户中的40万元属于您的所有，并且该款项已被不当使用或转移，您可以向法院提起诉讼，要求对方返还这些款项。 在提起诉讼之前，建议您先与对方进行协商，尝试通过和解方式解决问题。如果无法达成一致，那么您可以委托专业的律师代理您的案件，以便更好地维护自己的合法权益。同时，也可以考虑聘请一名证人或者专家来证明您拥有这笔资金的所有权。 此外，根据我国相关法律规定，对于非因故意而使他人财产受到损失的，可能需要承担一定的法律责任。因此，如果对方的行为确实造成了您的损失，您可以考虑寻求相关的法律救济途径，如请求赔偿等。 最后，由于情况较为复杂，建议您尽快联系专业的法律顾问，以便得到更准确和详细的法律意见。