挪用公款属于违法行为，即便在三个月内还清了，也不能改变其违法性质。根据我国《刑法》的相关规定，挪用公款的行为，如果数额较大或者有其他严重情节的，即使归还了款项，依然可能构成挪用公款罪。如果数额较小且没有造成严重后果，可能会受到行政处罚，但仍然存在法律责任。 具体是否构成犯罪，以及如何处罚，需要根据挪用公款的具体数额、情节严重程度、归还款项的时间等因素综合判断。如果涉及刑事责任，即使归还了款项，依然需要接受司法机关的审查和处理。因此，即使款项已经还清，也建议及时咨询专业律师，了解相关法律规定，以妥善处理可能面临的法律后果。