首先，关于您的情况，您与开发商达成的协议需要确保其符合法律规定。根据中国《城市房地产管理法》的规定，对于商品房销售中的变更事项，必须经过相关部门的批准，并且在签订买卖合同时，应当将变更后的相关事宜写入合同中。 其次，如果您想要更改房屋结构或使用功能，通常情况下需要到当地规划部门进行审批。因为这涉及到建筑物的安全性和合法性问题，因此建议您先向规划部门咨询，了解具体的要求和程序。 再次，关于银行能否修改购房合同的问题，不同地区的规定可能有所不同。一般来说，在购买商品房时，银行可能会要求购房者提供一份新的购房合同副本。如果您认为合同中有错误或者不合理的条款，可以联系银行，由双方协商解决。 最后，关于费用方面，由于我无法确定具体的费用，建议您直接咨询当地的房地产交易中心或专业的房地产律师，以获得更准确的信息。同时，也可以考虑聘请一位经验丰富的律师帮助您处理这一复杂的情况。