根据《中华人民共和国民法典》的规定，当事人对造成损害都没有过错的，可以根据实际情况，由双方分担损失。在本案中，如果承包商和业主对于防水层的问题都存在责任，则应当按照各自的过错程度进行分担。 首先，如果承包商未能正确施工或者使用不合格材料导致防水层损坏，那么承包商应承担主要责任；如果是由于业主未按合同约定支付工程款或提供必要的条件，如水电改造等，导致承包商无法正常施工，业主也应当承担责任。 其次，在此情况下，如果承包商已经完成防水层施工并交付给业主，而业主因自身原因（如未及时检查或维修）导致防水层受损，此时的责任则应当由业主自行承担。但如果是业主在保修期内发现防水层损坏，并向承包商提出修复请求，承包商有义务进行修复。 综上所述，具体责任分配需要根据具体情况分析，建议聘请专业的法律顾问协助处理。