你好！根据《民法典》的相关规定，如果甲方企业商标没有成功申请下来，那么他们与乙方签订的合同可能会因为缺乏有效的法律依据而被视为无效。然而，在具体案件中，需要考虑许多因素，包括但不限于合同的具体条款、双方当事人的权利义务、以及相关法律规定等因素。因此，建议你详细咨询一位专业的法律顾问，以获得最准确的答案。