您好，根据我国相关法律规定，如果一方在婚姻关系存续期间与他人同居，并且双方签订了协议离婚的文件，那么该协议离婚的文件是有效的。然而，在某些情况下，如果协议中涉及的条款违反了法律的规定或者违背了公序良俗，人民法院有权判决该部分无效。 如果您已经与对方签订了协议离婚的文件，并且其中的部分条款已经被法院认定为无效，您可以考虑重新协商并签订新的协议。新协议的内容应当符合法律法规的要求，并尽可能地维护双方的利益。 另外，建议您咨询专业的法律顾问，以便更好地了解您的权利和义务，并帮助您制定更合理的解决方案。