您好！关于您提到的案件，我作为专业的法律顾问，需要强调的是，根据我国相关法律规定，任何个人或组织不得采取非法手段获取他人财物。在您的情况下，如果甲方是从乙方向其支付的合作款项中直接扣除，且没有其他违法行为，则可能不构成犯罪。 然而，为了确保您的权益不受侵害，建议您在处理此类事务时，遵守相关的法律法规，并寻求专业人士的帮助和指导，以避免不必要的法律风险。同时，也可以考虑与对方进行沟通，协商解决方式，以达成双方都能接受的结果。