根据《中华人民共和国票据法》的规定，票据的出票人、背书人、承兑人和保证人在票据上的签章不符合规定的，其签章无效，但不影响其他符合规定签章的效力。因此，如果公司作为票据的收款人或付款人，在向银行提交了有效的商业汇票后，银行未按照约定的方式进行兑付，则可能涉及票据诈骗或其他相关法律责任。 在实践中，如果银行与公司之间的交易存在欺诈行为，如伪造商业汇票、虚假结算等，甚至涉嫌犯罪的，应当由公安机关立案调查，并依法追究相关人员的刑事责任。同时，银行也有义务对公司的信用状况进行审查，以防止此类情况的发生。 总之，对于公司承兑汇票兑现存入个人账户的问题，需要具体情况具体分析，如果存在违法违规的行为，应依法处理。建议公司严格遵守法律法规，确保经营活动合法合规。