在建筑施工过程中，如果施工单位使用了假材料，这可能会对工程的质量和安全造成严重影响。在这种情况下，监理单位是否有配合调查的义务取决于相关的法律法规以及双方签订的合同条款。 首先，根据《中华人民共和国建筑法》及相关法规，监理单位应当按照国家有关规定和建设工程承包合同的要求，对施工现场进行定期或者不定期检查，并做好记录。如果发现施工单位使用的材料不符合标准或存在质量问题，监理单位应及时向建设单位报告，并协助采取相应措施。 其次，在实际操作中，监理单位可能有配合调查的义务。例如，当发现施工单位使用假冒伪劣材料时，监理单位可以要求施工单位提供相关证明文件，如合格证、质量检测报告等；同时，监理单位也可以向当地市场监管部门反映情况，以便相关部门进行调查处理。 最后，监理单位是否需要配合调查还取决于具体的合同约定。不同的合同条款可能会有不同的规定，因此在具体案例中，应参考合同的具体内容来判断监理单位是否需要配合调查。 总之，监理单位有责任监督施工单位遵守相关法律法规和合同条款，对于施工单位使用的假材料，监理单位应当及时发现问题并向有关方面报告。在实践中，监理单位与施工单位之间的合作是维护工程质量的重要环节，双方应当共同履行各自的责任和义务。