经由村委会签署的协议是否需要公证取决于该协议的具体情况。一般来说，如果协议涉及土地使用权、房屋所有权等财产转移或者债务清偿等重要事项，且双方当事人同意并自愿选择公证，则应通过公证程序进行。否则，村委会所签署的协议可能并不具有法律效力。 对于您提到的协议内容对您不利的情况，建议您首先与对方协商解决，看是否存在修改的空间。如果无法达成一致，可以考虑聘请律师帮助分析协议的内容和效力，并根据法律规定维护自己的合法权益。在任何情况下，确保协议内容符合法律法规要求是关键。