根据我国相关法律规定，房屋所有权人有权按照合同约定或法律规定，处分其所有房产。在您的情况下，如果拆迁协议中明确标注了您父亲应得的面积，并且该面积已实际分配给您父亲，则这些面积应当归您父亲所有。如果您认为补偿金额低于您的期望，您可以考虑通过诉讼途径解决。 至于是否可以通过现金形式进行赔偿，需要具体分析拆迁协议中的条款以及当地的相关法律法规。一般来说，如果拆迁协议中有明确的规定，可以要求按照协议规定的方式进行赔偿；如果没有明确规定，可能需要向相关部门咨询或者与开发商协商。 请记住，任何法律问题都需要由专业的法律顾问来解答，以便获得最准确的信息和建议。如果有其他法律问题需要帮助，请随时告诉我。