在没有结婚的情况下，双方共同抚养一个三岁的孩子，并且已经分居了三年。这种情况可能涉及到孩子的监护权和抚养费等问题。根据中国婚姻法的规定，如果夫妻双方感情破裂，可以协议离婚或诉讼离婚。如果您想要解决这个问题，建议您咨询专业的家庭法律工作者，以便获得更详细的指导和帮助。 另外，关于孩子的监护权和抚养费的问题，具体需要考虑多个因素，包括但不限于孩子的年龄、健康状况、经济能力等。如果您有具体的法律问题或者需要进一步的法律服务，请及时寻求专业人士的帮助。