根据我国相关法律规定，夫妻双方因感情不和而分居满两年的，经调解无效的，人民法院应当准予离婚。因此，在您所描述的情况下，如果双方因感情不和分居满两年，并且在分居期间已经通过协商的方式达成了解决分歧的协议，那么法院可能会支持您的诉讼请求，判决解除婚姻关系。 但是需要注意的是，分居时间的具体认定需要结合实际情况进行判断，包括但不限于是否实际居住在一起、共同生活的时间长短等。此外，对于一方患有疾病的情况，法院可能会综合考虑病情对婚姻关系的影响以及双方的实际生活状况等因素来作出裁决。 最后，请务必注意保护自己的权益，必要时寻求专业的法律帮助以确保合法权益得到维护。