在您的情况下，如果司法机关已将不予受理通知书发送给了法院，并且您和对方当事人之间达成了解决协议并得到了法院的认可，那么通常来说，这可以被视为一个合法有效的解决方式。在这种情况下，您可以继续按照与法院的约定进行诉讼程序。 然而，如果您认为判决结果可能对您不利，或者有其他争议需要进一步处理，建议您考虑寻求其他的救济途径，例如申请再审或者其他司法途径。同时，确保在采取任何行动之前，遵守所有适用的法律规定和程序。 请记住，每个人的具体情况都是不同的，因此，在做出决定时，请务必咨询专业的法律顾问以获得个性化的建议。