根据《中华人民共和国劳动民法典》第四十六条的规定，“有下列情形之一的，用人单位应当向劳动者支付经济补偿。 （一）劳动者依照本法第三十八条规定解除劳动合同的； ……” 因此，在满足上述条件的情况下，公司扣留员工的全部或部分工资是不合法的。如果公司确实需要扣除一定的费用作为福利或者成本，应该在合同中明确约定，并且不得低于法律规定。 同时，对于因违反法律法规而被要求赔偿的行为，也需要考虑是否符合法律规定以及公司的行为是否合理。建议您详细阅读相关法律法规并寻求专业的法律意见以确保您的权益得到保障。