您好！公司私自从员工的工资中扣除部分是不合法的行为。这种行为违反了劳动法关于劳动者权益保护的规定，可能导致员工与公司的劳动合同关系受到影响，并可能引发劳动争议。 如果您遇到这种情况，建议您采取以下措施。 首先，您可以尝试与公司进行沟通和协商，要求其退还被扣除的部分工资。 如果与公司无法达成一致，可以考虑向当地的人力资源和社会保障局投诉或申请劳动仲裁。 在处理过程中，确保保留好相关的证据材料，如聊天记录、转账凭证等，以便于后续维权时使用。 请注意，不同地区对劳动法规的理解可能存在差异，请根据实际情况选择合适的解决方案。希望我的回答能够帮助到您！