如果在购房协议中约定了具体的违约责任，并且该条款明确说明了乙方不配合甲方办理过户的法律责任，那么根据合同法的规定，乙方应当承担相应的违约责任。具体而言，可能包括但不限于支付违约金、赔偿损失等。 同时，如果购房协议没有约定具体的违约责任或者违约责任不明晰，建议双方协商解决，通过调解或仲裁等方式解决争议。如果协商不成，可以向法院提起诉讼，由法院依法判决。 需要注意的是，在处理此类纠纷时，应当遵守法律法规和相关司法解释，确保案件处理过程合法合规。