在某些情况下，即使被告人的车辆已被抵押，法院仍然可以冻结其财产。这通常是因为被告人在诉讼过程中被裁定为“无财产”或者没有足够的资产来支付债务。在这种情况下，法院可能会采取措施来保护自己的利益，包括查封或冻结被告人的其他财产。 然而，在这种情况下，必须确保所有相关方都了解法院的权力，并且遵守法律规定。此外，为了避免潜在的风险和后果，建议在进行任何行动之前，寻求专业的法律意见。