您的情况涉及公司的设立和股权分配，需要考虑多个方面的问题。 首先，根据《中华人民共和国公司法》的规定，股东的出资额应当在公司章程中载明，并且必须全额缴纳。因此，如果其中的一个自然人出资不足，其他股东的出资也必须相应减少，以确保总股本达到法定要求。 其次，按照法律规定，有限责任公司股东会是公司的最高权力机构，负责审议并决定公司的重大事项。在这种情况下，如果其他股东同意将该自然人的股份份额从51%降到49%，则需要通过股东会决议，并且所有股东都必须一致同意，否则该决议无效。 最后，您提到的“其余股东出资900万元”未明确是否包括了该自然人的出资。如果这部分出资也被其他股东认可，则可以视为全体股东的一致同意；但如果这部分出资没有得到其他股东的认可，那么只能视为部分股东的意愿，而非全体股东的共识。 综上所述，如果您希望维持当前的股权结构，建议与全体股东进行协商，确保所有股东的意见一致。如果有必要，可以通过法律途径解决争议，以保障公司依法合规运营。