在某些情况下，开发商将三楼的店面改为公寓并进行销售可能是合法的。这取决于具体的城市法规和政策。 首先，需要明确的是，在中国，房地产开发项目通常需要经过严格的审批程序才能获得许可。如果开发商已经按照相关法律法规进行了所有必要的手续，并且在建设过程中没有违反任何规定，那么其有权自行决定将三楼的店面转变为公寓进行销售。 然而，需要注意的是，即使开发商拥有合法的权利，仍然可能存在一些限制或条件。例如，如果这种转变影响到了其他业主的利益，或者损害了公共利益，开发商可能需要承担相应的法律责任。 此外，需要注意的是，虽然有些城市对房地产开发有严格的规定，但不同地区的具体情况可能会有所不同。因此，对于这个问题的具体情况，建议您咨询当地的房地产专家或法律顾问以获取更准确的信息。