关于您提到的“买房主体合同”中的第六条明确的买卖房屋情况与签订的补充协议之间的关系，以及该补充协议的有效性，需要具体情况具体分析。 首先，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同应当是双方当事人的真实意思表示，并且不违反法律法规的强制性规定。如果一方在签订合同时存在欺诈、胁迫等情形，或者是在订立时有重大误解的情况下，那么该合同可能无效或可撤销。 其次，补充协议通常是对主合同条款的具体化、完善化或者对主合同未尽事项进行约定。如果补充协议的内容并未超出主合同的基本框架，且没有违背法律规定，则补充协议可以视为主合同的一部分，具有与主合同同等的效力。 然而，在您的情况下，由于补充协议与主体合同存在冲突，这可能会导致主合同的部分条款无法执行，从而影响整个交易的顺利进行。因此，建议您仔细审查并确认补充协议的内容是否合法、合理，并确保其不会损害自身权益。 最后，如果您认为补充协议与主体合同存在严重分歧，或者存在其他不利于自己的因素，建议及时向专业人士寻求帮助，如律师或其他法律人士，以便更好地理解和应对可能出现的问题。