在签订工伤赔偿协议的情况下，如果公司最终申请破产，通常情况下，该协议中的赔偿条款可能会受到影响。这取决于协议的具体规定以及破产程序中对债务偿还顺序的规定。 一般而言，如果公司在破产程序中被认定为有偿债能力，并且在破产清算前已经支付了部分或全部的赔偿款，那么这些赔偿款项可能需要重新分配以满足债权人和其他利益相关者的权益。这意味着赔偿款可能不足以完全补偿所有受害者，或者赔偿款可能会因优先权的问题而无法全额支付给每位受害者的家属。 在这种情况下，受影响的员工和他们的家人可能有权要求法院进行干预，以确保他们能够获得公平的赔偿。此外，还可以考虑寻求其他途径来保障受害人的合法权益，例如通过劳动仲裁、诉讼等方式维护自己的权益。 总之，在处理这类情况时，重要的是要详细了解具体的法律规定和公司的破产程序，以便做出最合适的决策。同时，也建议与专业的法律顾问进行沟通，获取更详细和准确的信息和建议。