您好，根据您提供的信息，确实存在一些不公正的情况。首先，根据劳动法规定，劳动者在试用期内（一般为3个月）可以提前3日通知用人单位解除劳动合同，因此您的两个月试用期并未完全履行，且未能得到应有的补偿。 其次，在合同中应当明确规定工资支付的时间和方式，如果公司没有按照约定时间发放工资，则可能违反了相关法律法规，构成拖欠工资行为。建议您向当地人力资源和社会保障局投诉或申请仲裁，以维护自己的合法权益。 此外，关于档案文件的整理，通常情况下是公司安排专门人员进行处理，并由公司承担相应的费用。如果您认为自己受到不公平待遇，请务必保留好所有证据，并及时与公司沟通解决问题。希望您能尽快获得解决，保护自己的权益不受侵害。