村主任侵占农民的水田是否构成犯罪需要根据具体情况来判断。如果村民已经依法取得了该土地的所有权或使用权，并且村主任没有合法地占有和使用该土地，那么村主任可能侵犯了农民的土地所有权或使用权。 如果村主任的行为是出于非法占有或者恶意侵占，例如通过欺诈、胁迫或者其他不正当手段取得土地所有权或者使用权，则可能会构成侵占罪或者其他相关罪名。在这种情况下，村主任有可能面临刑事处罚。 然而，如果村主任的行为仅仅是出于个人利益的私欲而侵占他人财产，但并未达到非法占有或侵占的程度，这种情况则可能仅被视为民事纠纷，而不是刑事案件。 因此，在处理此类案件时，应具体分析案情，依据法律规定进行定性。同时，建议当事人寻求专业的法律顾问帮助，以便更好地保护自己的合法权益。