你好！根据相关法律规定，如果保险公司在赔偿时会扣除被保险人已经支付的合理费用。因此，在你的情况下，保险公司应该首先赔付1万元的修理费，并且可能需要从你的保险金额中扣减这部分费用。 至于剩余的赔偿金额（即29万元），这取决于法院的判决结果。如果你认为自己的损失超过了保险公司的赔偿范围，你可以考虑向对方提起诉讼，要求其承担额外的责任或赔偿。 最后，建议你在与保险公司沟通时详细说明情况，以便得到最准确和及时的处理。同时，也可以寻求专业的法律帮助以确保权益得到充分保护。