您好！根据《中华人民共和国民法典》的规定，合同当事人有权约定违约责任。在本案例中，如果双方同意按照合同约定执行，那么培训机构可以收取一定的费用作为违约金；如果培训机构坚持要求全额扣除手续费，则可能涉及违约行为。在这种情况下，建议您与培训机构协商解决，并明确告知对方您的权利和期望。同时，也可以考虑向消费者保护组织或行业协会寻求帮助，以维护自己的权益。