根据您提供的信息，您已经支付了5000元来解决与单位同事的纠纷，并且有领导在场见证。这种情况下，如果双方自愿达成和解并签署了协议，那么警方可能会考虑撤回案件。 然而，需要注意的是，即使双方已经签订了和解协议，仍有可能存在未尽事宜或未来可能发生的问题。因此，在处理此类事件时，最好寻求专业的法律建议，以确保您的权益得到充分保护。同时，如果您需要携带领导前往派出所，请务必事先征得他们的同意，并告知他们所涉及的具体情况。