关于不同种类的签字笔签署的协议书是否有效的问题，需要考虑多个因素。 首先，协议是双方当事人自愿签订的书面文件。在某些情况下，虽然两种不同的签字笔可能无法完全一致地表示出所约定的内容，但这并不意味着该协议无效。 其次，合同法规定，如果一方当事人没有按照合同的规定履行义务，另一方可以要求其承担违约责任。因此，在这种情况下，即使签字笔不同，只要协议内容真实且各方意思表示一致，仍然可能导致法律责任。 然而，需要注意的是，实践中有时会出现签名不一致的情况，这可能会导致合同效力受到影响。在这种情况下，应当仔细审查协议的其他证据，如日期、地点、交易金额等信息，以确保所有重要事项均得到准确记录。 总之，虽然不同签字笔签署的协议书可能因细节差异而存在争议，但只要协议内容明确，并得到了双方的真实意愿确认，通常不会影响协议的效力。然而，在实际操作中，为了最大程度上避免纠纷，建议在任何涉及法律事务的情况下，尽可能使用相同类型的签字笔进行签名。