根据您提供的信息，如果离婚协议书中明确写有双方共同承担大学费用，并且法院在判决中也确认了这一点，但只判决了两年的费用，这可能是基于法院对案件具体情况的考量，比如经济能力、子女教育的实际需要等因素。 如果判决结果与离婚协议书的内容不符，或者您认为判决不公平，您有权在判决书送达之日起15日内向原审法院提出上诉，请求重新审理。在上诉过程中，您可以提供更多的证据和理由来支持您的主张，比如协议书的具体内容、双方的经济状况、子女教育的实际需要等，以期获得更公正的判决。 同时，如果判决已经生效，但您认为判决内容不合理，您还可以通过执行异议程序来提出异议，要求法院重新审查判决内容。但请注意，执行异议需要在执行程序开始后提出，并且需要有充分的理由和证据支持。 总之，面对法院的判决，您有权利通过法律途径来维护自己的权益。建议您咨询专业律师，了解更详细的法律程序和可能的解决方案。