首先，您提到的房子属于您的父亲，但您们签订了一份三方协议，其中约定房屋的所有权将归属于您。因此，根据该协议，房屋的所有权应该归属于您。 其次，关于在拆迁过程中建造的门房和井，它们的价值应当按照双方各自份额来确定归属。由于您们已经签订了三方协议，那么根据协议中的约定，这些财产应该属于您。所以，对于这部分价值，它应该是按照你们各自的份额进行分配的。 最后，如果您认为这份协议不足以明确所有事项，您可以考虑通过法律途径解决争议。例如，可以向法院申请确认该协议的有效性，并要求对涉及房产及附属物的相关事宜作出裁决。在这个过程中，您可以聘请专业的法律顾问帮助您更好地维护自己的权益。