在大多数情况下，工厂或雇主不得因员工在工作场所喝水而扣除工资。这种做法违反了劳动法中关于劳动者休息和饮水的规定。然而，在某些特定的情况下，如果员工在工作期间频繁使用洗手间或者长时间不在工作岗位上导致影响生产效率，则可能需要考虑是否合理地安排工作时间和休息时间。 如果您认为您的权益受到侵犯，请及时与雇主沟通并寻求解决方案。如果情况较为复杂，建议您寻求专业的法律意见。