根据《民法典》的规定，如果企业对退货的药品质量有疑义，并且在合理期限内向销售商提出质疑，但销售商未及时提供合格证明文件或补充检验报告等证据材料支持其产品是合格的，则销售商应对该部分不合格药品承担相应的赔偿责任。因此，如果企业认为退货的药品存在质量问题并已向销售商提出异议，而销售商未能提供足够的证据证明产品质量合格，那么企业有权要求销售商按照合同约定支付相应比例的赔偿金。 然而，在实际操作中，具体的赔偿金额和方式可能会因具体情况而异，例如是否涉及欺诈行为、是否存在恶意退药等问题。此外，即使销售商提供了足够的证据证明产品质量合格，也不能完全排除企业追究销售商违约责任的可能性。 综上所述，企业可以考虑通过法律途径解决与销售商之间的纠纷，以维护自身合法权益。具体而言，可以通过诉讼等方式要求销售商按照合同约定进行赔偿，并收集相关证据以支持自己的主张。同时，也可以寻求其他途径如协商、调解等方式解决争议。