你好！根据《中华人民共和国民法典》的规定，农民集体所有的土地使用权不得用于非农业建设。因此，如果农村集体经济组织将农民的集体土地使用权作为投资或资本投入其他单位，并且该单位利用这些土地进行商业活动，则可能存在违法行为。 然而，在这种情况下，合作社是否收取政府的利息是另一个问题。合作社与政府之间的关系和性质可能涉及不同的法律规定和政策，这需要具体分析。如果你有更详细的问题，请提供更多信息以便我能够给出更为准确的回答。