您好！关于您购买的商品房和楼上所建房屋的关系，通常情况下，您有权要求对方停止施工并赔偿您的损失。具体来说。 您有权要求对方停止施工，以避免对您的合法权益造成进一步的侵害。 如果对方继续施工，您可以向法院提起诉讼，请求法院责令其停止施工，并承担相应的法律责任。 在处理此类纠纷时，建议您与对方进行协商，寻求和平解决的可能性。如果无法达成一致，可以考虑通过法律途径解决问题，以维护自己的权益。