在处理涉及儿童抚养权的问题时，通常需要考虑多个因素，包括但不限于孩子的年龄、健康状况、情感联系等。在您提到的情况中，孩子已经3岁，并且双方都已经分居了三年。在这种情况下，如果双方都能提供充分的证据证明自己对孩子的照顾和教育更加有利于孩子的健康成长，那么法院可能会倾向于判决孩子随其一方生活。 然而，在这种情况下，考虑到孩子已经3岁，并且已经有3年的分居时间，这可能意味着双方在情感上的疏远和缺乏沟通。因此，法官可能会更多地考虑孩子的最佳利益，而不是简单的性别或年龄差异。此外，由于孩子已经到了可以表达自己的意见和感受的阶段，法官可能会更倾向于听取孩子的意见。 最终，决定抚养权归属的最佳方式是通过法庭听证会进行裁决，由法官根据具体情况作出判断。在此过程中，您可以与您的律师紧密合作，收集所有必要的证据和支持材料，以支持您对孩子最好的长期福祉的看法。