根据《中华人民共和国劳动法》第四十四条规定。“安排劳动者延长工作时间的，支付不低于工资的百分之一百五十的工资报酬；休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的百分之二百的工资报酬。” 在实际操作中，如果企业按照最低工资标准计算加班费用，可能会导致员工的实际收入低于法定最低工资水平。因此，在处理此类争议时，建议双方协商解决，并尽可能达成一致意见。 此外，根据《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律若干问题的解释（二）》的规定，当劳动者与用人单位就加班费支付存在争议时，应当以国家规定的最低工资标准作为基数进行计算。 综上所述，虽然加班费的标准可以由企业和员工自行约定，但应确保其符合法律规定，避免因违法而产生的纠纷和责任。如果发生争议，建议通过协商或向劳动仲裁机构申请调解等方式寻求解决方案。