在建筑工程承包协议中，双方已经签字确认了合同的条款和条件。如果没有加盖公章或合同专用章，则该合同可能不具备法律效力。然而，如果该合同经过公证或有其他形式的证明，例如通过银行转账等方式明确表明双方已履行相应的义务，并且没有违反法律规定，则该合同仍然具有法律效力。 在实践中，建议在签署任何重要文件时确保其完整性和合法性，以避免未来可能产生的争议。如果您需要进一步的法律指导，请咨询专业的法律顾问。