《中华人民共和国建筑法》第四条规定。“建设单位应当按照国家有关规定办理选址意见书、建设用地规划许可证和建设工程规划许可证等手续，并依法取得各项许可。”因此，如果要改变厂房的结构布局，必须先获得相关部门的审批。根据您的描述，您希望将原来的三层改建为六层，但并没有提供足够的信息来确定是否符合相关法规。 一般来说，如果原厂房屋顶高度低于5米，则可以进行扩建；如果高于5米，那么需要经过城市规划部门的批准。然而，具体是否可行还需要详细考虑建筑物所在地区的相关政策和规定。 此外，任何建筑活动都可能涉及到安全和环境保护等方面的问题，因此在决定进行改造之前，建议咨询专业的建筑师或工程师，以确保所有必要的程序都被遵守，并且不会对周边环境造成不利影响。