在工程合同中，通常会约定因不可抗力因素导致的工期延误应按照双方协商后的具体条款处理。如果双方已经达成书面协议，并且协议中明确表明了对工期延期的处理方式，那么在符合协议规定的情况下，可以考虑不追究违约责任。 然而，需要注意的是，在某些情况下，即使双方已达成协议，也不排除法院可能认为工期延误是由于一方或多方的责任所引起的，从而决定追究对方的法律责任。因此，对于此类情况，建议在签订合同时详细列明各方的责任和义务，以避免日后产生纠纷。