根据您的描述，您在入职后六个月内提出离职，并且公司已经同意了您的离职请求。但是，在收到通知时被告知需要扣除三分之一的工资作为补偿。 关于是否可以扣除剩余工资的问题，通常情况下，除非有明确的法律规定或协议约定，否则用人单位不得无故扣除员工的工资。此外，如果员工在入职后六个月内提出离职，并且公司在确认其离职请求后同意并执行了该决定，那么公司应当按照法定程序支付相应的赔偿金，而不是要求额外的补偿。 因此，建议您与公司的人力资源部门进行沟通，了解具体的情况和处理流程，以便更好地维护自己的合法权益。同时，如果您认为公司存在不合理的要求或者违反劳动法规的行为，也可以考虑向当地的人力资源和社会保障部门投诉，以寻求帮助和支持。