房屋权属证书的面积与实际面积有差异时，应按照以下原则处理。 如果双方签订的买卖合同中明确约定了面积，并且实际测量也确认了该约定面积，则应当以合同约定的面积为准。 如果合同中没有明确约定面积，或者实际测量的结果与合同约定的面积存在较大差异（如相差5%以上），则可能需要进行补充协议或重新协商解决。在协商过程中，可以要求开发商提供详细的技术报告和施工记录等证据，以便证明合同中的面积确实在实践中不存在偏差。 如果确实存在争议，可以通过法律途径解决。根据我国相关法律规定，如果合同中有明确的面积约定并且实际测量结果与合同约定差距过大，购房者有权请求法院撤销合同或者变更合同内容。 在任何情况下，都应该尊重合同当事人的真实意愿，遵守诚实信用的原则，通过合法手段维护自己的合法权益。