根据您提供的情况，您在2015年出售房产，并在2016年5月交付房产，合同中约定了您需要迁移户口，并且有2万元的押金。现在您已经完成了户口迁移，但对方要求扣除违约金，按照万分之三的比例计算。 首先，违约金的扣除通常是基于合同中的相关条款。如果合同中明确约定了逾期迁移户口需要支付违约金，并且违约金的计算方式是万分之三，那么对方有权按照合同执行。但需要注意的是，违约金的计算应基于实际逾期的时间，即从合同约定的迁移户口截止日期到您实际完成迁移的日期。 其次，如果合同中没有明确约定违约金的条款，或者违约金的计算方式不合理，您可以与对方协商解决。协商不成的情况下，可以寻求法律途径解决争议。 最后，如果违约金的扣除确实存在不合理之处，或者对方在扣除违约金时没有遵循合同约定，您可以要求对方提供合理的解释，并根据实际情况决定是否接受违约金的扣除，或者通过法律途径维护自己的权益。