首先，根据您提供的信息，您的朋友已经在银行确认了借款和还款的事实，并且已经开始按照约定分期偿还。这表明他已经履行了自己的还款义务。 其次，根据相关法律规定，如果借款人已明确表示同意将还款资金用于指定用途，并且还款行为没有违反任何法律法规，那么银行无权直接冻结该笔款项。 因此，尽管银行可能因为其他原因（如经济状况恶化等）暂时冻结了您的国家粮食补贴专款，但这种冻结措施必须符合法律规定并遵循合理程序，以确保其合法性。 建议您与银行沟通，了解具体情况并寻求专业的法律意见，以便更好地保护自己的权益。同时，也请注意保留相关的书面证据，以备不时之需。