根据我国相关法律规定，夫妻双方因感情不和分居满两年以上，经调解无效可以协议离婚。因此，如果女方已经离开男方居住地达两年以上，并且男方与她有充分的理由相信对方已永久性失踪或死亡，男方可以向人民法院提起诉讼要求解除婚姻关系。 在进行离婚诉讼的过程中，男方需要收集相关的证据证明自己对女方的合法权利，例如，男方需要提供关于妻子失踪的证明材料，比如医院出具的病历、公安局的失踪报案记录等；此外，还需要提供夫妻共同财产分割的相关证据，以及子女抚养权的证明材料等。 同时，在进行离婚诉讼时，男方需要聘请专业的律师帮助自己进行诉讼。因为涉及离婚案件的处理涉及到复杂的法律程序和大量的法律知识，如果没有合适的律师指导，可能会导致自己的权益受到损害。 因此，建议男方尽快寻求专业律师的帮助，以便能够顺利地完成离婚诉讼并获得公正的判决。